沒煮熟的金針菇中含有“秋水仙鹼”，食用後會產生有毒物質“二秋水仙鹼”，導致食用者出現腹痛、腹瀉和嘔吐等問題。而秋水仙鹼不耐熱，加熱後就會被破壞掉。所以孕婦吃金針菇一定要等煮熟透後再吃，食用前在冷水中泡會也可溶解掉一部分秋水仙鹼。
金針菇性寒，且不好消化，所以脾胃虛弱、寒性體質及經常腹瀉的孕婦應少吃。
另外，金針菇含嘌呤物質較多，每100g金針菇含嘌呤60g左右，所以關節炎的孕婦需慎重食用。
孕婦吃金針菇時最好不要與這些食物同吃，以免引起身體不適。比如金針菇與高鈣、高纖維和寒性食物同吃，容易導致消化不良。
金針菇與蛤蜊同吃會破壞金針菇中的維生素B1，導致營養流失。
