目前國內電商平臺上有衆多仿冒日研所的納豆激酶品牌，消費者在購買時一定要選對品牌，日本納豆激酶協會認爲，真正的納豆激酶是由日本生物科學研究所研發的，它是由275個氨基酸組成的分子量爲27700爲1本鎖Horipepchido(多肽)結構絲氨酸，是纖維蛋白溶酶原和纖溶酶爲媒介的具有fibriolysis(分解纖維蛋白)作用的成分，激酶含量達到原料200萬FU/100g、成品2000FU/粒，不含嘌呤、不含維生素K2，未檢測出大豆異黃酮(黃豆苷元和染料木酮苷元)，不含色素、防腐劑。其產品安全性、穩定性、功效性檢測均符合日本納豆激酶協會的要求，取得該協會的產品認證標誌。目前這款《日本第三代天然超級納豆激酶》(中文名稱金樂活)近期已授權中國市場銷售許可。
日本國厚生勞動省醫藥食品局食品安全部主管的財團法人日本健康營養食品協會唯一認定的納豆激酶標註單位是“FU”。“F”是英文血栓纖維蛋白fibrin的縮寫，“U”是英文單位unit的縮寫，“FU”的含義爲分解纖維蛋白也就是血栓的單位。
目前市場上有些納豆產品標註的“IU”、“U”和“FU”是完全不一樣的概念。如果產品以“IU”、“U”爲單位，那麼日本納豆激酶協會就認爲該產品並不是納豆激酶產品，有可能是其他酵素產品。
也可以從日本納豆激酶協會或者日本健康營養食品協會官方網站上查詢生產廠家，以驗證是否是經權威認證的正規生產廠家的產品。還可以通過查看納豆激酶產品的顏色、氣味、形狀等加以區分。通過人工血栓試驗也可以直觀地判別。
早前日本電視臺在晚間新聞NEWS ZERO中，曝光了免稅店坑騙中國遊客的內幕，根據調查公司的數據：這家店的老闆是韓國人，全國共有20多家店鋪，年銷售額達到500億日元(30億人民幣)，中國遊客是其主要銷售對象。進入免稅店，隨處可見大幅的野口英世照片，以及“野口英世研究所”的保健品。
然而節目組卻發現，納豆A的成分表上並沒有“納豆激酶”，而是一種“納豆精華”的成分。隨後，欄目組聯繫兩家研究機構，證實納豆A中並不含有“納豆激酶”。製造商“野口英世研究所”聲稱：“產品中的確不含有“納豆激酶”，販賣店員的虛假解釋，和製造廠家無關，屬於銷售方自己的責任”。
對於納豆類產品，目前醫學上還沒有臨牀數據表明它對心血管疾病有明確的治療作用。“沒有臨牀實驗數據的驗證，是無法說明一種產品具有治療作用的。而作爲保健食品，服用納豆膠囊只能起到預防的作用。
