蜂膠與西藥一起食用，會破壞蜂膠的功效，如果是特殊情況需要服用西藥，也應相隔半小時或一小時以上再服用。
蜂膠屬於中藥材，含有多種藥效成分，而茶水中含有單寧酸、咖啡因等物質，具有解藥功效，因此，蜂膠和茶水一起吃會降低蜂膠的功效，並且這兩種一起吃口味也極差，還容易使蜂膠粘在杯壁上。所以蜂膠不宜用茶配服。
蜂膠的主要成分是各種植物的膠質物質，它自身存在一定的毒性，因此，蜂膠不能夠和容易過敏的食物一起吃，不然會引發過敏反應，常見的過敏食物有芝麻、芹菜、花生、堅果、牛奶、雞蛋等。
蜂膠裏面還有很多的黃酮、黃酮醇類物質，一般食用後會促進身體合成雌激素，如果再與雌激素類的食物一起吃，容易導致體內的雌激素增加，這對月經和正常孕育有一定的影響。含雌激素比較多的食物有牛奶、洋蔥、小麥、茴香、豆漿、黑米等。
