檸檬水中含有很多檸檬酸，孕婦適量飲用可以促進食慾、防止妊娠孕吐，但如果一次飲用過多則會導致胃酸過多，引起噁心、反胃等不適，對胃造成傷害。
檸檬水本身含有大量的酸性物質，特別是檸檬酸含量相對較高。如果在空腹狀態下飲用過多檸檬水，就容易刺激胃酸的過度分泌，對胃部造成傷害，長期如此甚至會導致胃潰瘍的出現，所以不僅是孕婦，其他人也應避免空腹喝檸檬水。
孕婦喝冰的檸檬水可能會刺激子宮，導致子宮收縮，因此最好是喝常溫的。
檸檬皮雖然含有豐富的鈣質，但是檸檬片味道苦澀不宜長時間浸泡，所以要現泡現喝。且檸檬切開後保質期會嚴重縮短，最好一次用完。
不宜用熱水沖泡
泡檸檬的水對溫度要求比較高，如果使用剛燒開的水，就容易破壞檸檬中所含有的營養成分，同時還會破壞檸檬水的口感，不僅變得更酸，還有絲絲苦味難以下嚥。而太涼的水沖泡出來的檸檬水清香味不夠。所以，最好是用60℃-70℃的水沖泡。
檸檬一定要帶皮切片，且最好是且的薄薄的。因爲皮的部分含類黃酮更高，比檸檬果肉更值得泡，檸檬精油也主要在皮裏面，薄切則檸檬皮中的香氣成分容易泡出來。
