飛蚊症分生理性和病理性兩種，生理性的飛蚊症症狀較穩定，一般不影響視力，不需要特殊治療。平時可多注意休息，不要過度用眼，同時多吃富含維生素A、C、E、B的食物，對眼睛有好處的食物。
病理性的飛蚊症會損害視力，所以要根據病情病因對症治療，常見用藥有氨碘肽滴眼液、口服卵磷脂絡合碘等碘製劑，可促進眼部微血管循環，促進滲出物的吸收。另外，還可使用一些對眼睛有營養的藥物，比如括葉黃素、維生素等製劑。
檢測發現飛蚊症患者出現視網膜裂孔甚至視網膜脫離時，需要進行視網膜激光治療或手術治療。如不伴有視網膜脫離的視網膜裂孔，可單純採用激光治療即可封閉裂孔即可。
飛蚊症患者還可採用中醫治療，其效果很不錯。
溼熱蘊結型飛蚊症：多見於炎性玻璃體混濁，治以利溼清熱;
氣滯血瘀型飛蚊症：多見於玻璃體積血，治以活血化瘀;
肝腎虧損型飛蚊症：多見於高度近視的玻璃體液化，治以補益肝腎。
