香連丸具有清熱化溼，行氣止痛之功效。主治大腸溼熱所致的痢疾，症見大便膿血、裏急後重、發熱腹痛;腸炎、細菌性痢疾見上述證候者。
方中以大量黃連清熱燥溼，解毒止痢;伍以少量木香行氣止痛而除腹痛、裏急後重;取吳茱萸制黃連，既制黃連之苦寒，又能調和肝胃。諸藥相合，共奏清熱燥溼，行氣止痛之功。
