杞菊地黃丸的副作用尚不明確。
杞菊地黃丸由六味地黃丸加枸杞子、菊花而成。八種藥物配伍組合共同發揮滋陰、養肝、明目的作用，對肝腎陰虛同時伴有明顯的頭暈視物昏花等頭、眼部疾患，尤爲有效。杞菊地黃丸是純中藥製劑，一般來講，副作用是比較小的，服用杞菊地黃丸2周左右就會有比較明顯的效果。如果想要有更好的治療效果，可能還需要在持續服用一段時間。
1.忌不易消化食物。
2.感冒發熱病人不宜服用。
3.有高血壓、心臟病、肝病、糖尿病、腎病等慢性病嚴重者應在醫師指導下服用。
4.兒童、孕婦、哺乳期婦女應在醫師指導下服用。
5.服藥4周症狀無緩解，應去醫院就診。
6.對本品過敏者禁用，過敏體質者慎用。
7.本品性狀發生改變時禁止使用。
8.兒童必須在成人監護下使用。
9.請將本品放在兒童不能接觸的地方。
10.如正在使用其他藥品，使用本品前請諮詢醫師或藥師。
