有時候這種病毒感染性疾病會自行消失，不需要治療，而且也不會留下瘀痕。
說明：
如果是自行痊癒的話，時間可持續多年，這種病症一般患者沒有自覺症狀，只是影響美觀，所以一般不嚴重的也沒多在意。
採用藥物治療是很常見的。建議到正規的醫院讓醫生開藥。
一般外用藥物可以用維a痠軟膏、咪喹莫特軟膏等治療。
外用藥物方法如下：
第一種：
取1瓶苗嶺消疣膏。把乾淨的牙籤放入消毒酒精中浸泡後，扎破疣體的一點皮，之後用衛生棉籤蘸取適量的藥膏，直接塗於破口處，破口會有毒血流出，並自然結痂。
第二種：
取板藍根20克，白花蛇舌草15克，貫衆15克，半枝蓮10克，蒲公英10克，土茯苓10克，烏梅10克，甘草6克，細辛5克。
將上述藥材全部置於鍋中，然後往鍋中加入清水1000毫升，以常規方法煎煮至500毫升時濾出，放涼，待藥溫降至45攝氏度左右，即用藥液清洗、溼敷患處10—25分鐘的時間。每日1劑。
第一種：
每日取金銀花30克，防風20克，蒼耳子10克，大青葉10克，桑葉10克，丹皮10克，荊芥10克，蟬衣10克，甘草10克。
將上述藥材全部置於鍋中，然後往鍋中加入適量的清水，以常規方法煎煮，水煎3次後將煎煮所得的藥汁混合，分2次口服。
第二種：
每日取生龍骨30克，生牡蠣30克，土茯苓30克，蒲公英30克，大青葉30克，磁石30克，馬齒莧15克，桑葉10克，紅花9克，赤芍9克，野菊花6克。
先將生龍骨、生牡蠣、磁石單獨放入鍋中煎煮取汁，再將剩餘的其他藥材一起置於鍋中，加水以常規方法煎煮。煮沸後濾出，取汁服用。
第一種：
取合谷穴、曲池穴、四白穴、血海穴、三陰交穴、太沖穴。
用毫針刺，行瀉法，每日針刺1次，每次留針30分鐘。
第二種：
取耳背降壓溝內緣，上耳背、中耳背、下耳背。
對局部常規消毒後選擇暴露較爲明顯的毛細血管或淺表小靜脈，用三棱針或刀片點刺，出血後用酒精棉球壓迫止血，最後用膠布固定。
第一種：
取青殼鴨蛋7只。浸泡米醋中5--7天后，每日煮食(生食更好)1只。
4--5天后，扁平疣患部皮膚潮紅，連續食用至痊癒。
第二種：
用綠豆、薏苡仁等量。先將綠豆水煮，沸後煮片刻，將薏苡仁倒入同煮爲粥。
每晚睡前食用。可以逐漸的治癒扁平疣。
第三種：
取薏米仁50克。煮粥，加白糖15克食之。
每日1--2次。可長期食用。
第四種：
取桑葉、菊花、連翹、薄荷、桂枝、杏仁、牛蒡子、生地、玄蔘、蟬衣、銀花各10克，生草5克，每日1劑，水煎。
分兩次內服，2周至1個月爲一個療程。
第五種：
病久者選用生牡蠣30克，丹蔘、雞血藤、玄蔘各15克，當歸、紅花、紫草、赤芍、川芍、白蒺藜、三棱、莪術各10克。
每日1劑，水煎，分兩次內服，長期的服用，可以使扁平疣疣體萎縮，然後徹底治癒。
第六種：
取炒牛蒡子200克，研細末去皮，裝瓶備用。
每日3次內服，每次3--5克溫開水沖服，一般藥盡病癒。
這種方法是治療扁平疣比較常見的， 雖然能夠快速將扁平疣去除，但是缺點是容易復發。
復發原因：
由於扁平疣病毒是在表皮下面，激光只能剷除表面扁平疣顆粒，而皮下病毒沒有剷除。
1、不要酗酒，不要空腹喝酒，空腹喝酒更容易吸收乙醛。
2、在吃燒烤時不要吃直接與炭火接觸的食物，其含有的致癌物比電烤和加鐵板燒烤的要多。
3、少吃動物油和肥肉，均衡飲食，以主食爲主，多吃蔬菜和水果。
4、醃製食品容易微生物污染，會傷肝。可適當補充B族維生素和礦物質，如穀類食物。
5、不吃不潔淨的食物，尤其是黴變的花生以及沒有醃製好的酸菜。
6、少吃發物，忌食蔥、蒜、辣椒、菸酒等刺激性食物。
