魚腥草帶有很濃烈的魚腥味。服用魚腥草泡水後，口氣會變臭，短時間內也很難消掉。
有些人喝魚腥草泡水或者是注射魚腥草注射液時可能會出現過敏反應，主要的表現就是身體出現藥物性皮炎、末梢神經炎、過敏性紫癜等症狀。因此，過敏性體質的人在服用魚腥草泡水時一定要特別注意。魚腥草過敏之後應立即就醫治療，停止對魚腥草的食用，不然很有可能導致嚴重的後果。嚴重者可引起過敏性休克，乃至死亡，應引起足夠的重視。
魚腥草含有馬兜鈴內酰胺。馬兜鈴內酰胺誘發腎臟損傷與馬兜鈴酸類似，過量食用魚腥草可能引發馬兜鈴腎病。
魚腥草味辛，性寒涼，歸肺經。由於魚腥草性寒，所以比較適合肺熱體質的人服用。一般人服用過多的魚腥草泡水很有可能導致體寒，從而引起腹瀉等症狀。所以，魚腥草泡水喝應當適量，不能飲用過多。
導致脾胃虛寒
魚腥性微寒，服用過多容易導致脾胃虛寒，從而引發胃病，導致體虛等。在日常生活中，食用魚腥草一定要考慮自己的身體素質並適量，特別小孩子更要嚴格控制好量。
魚腥草本身是含有毒性的，但是毒性甚小，一般情況下這種毒性對人體並沒有太大危害。可是，有時也會引發局部疼痛。因此食用魚腥草一定要在合適的範圍內，不能食用過量。每次3～5錢(鮮者1～2兩)即可。
