一般不會癌變。
扁平疣雖然也是hpv病毒感染所致，但hpv病毒種類有很多，不同型的HPV病毒致癌性不同，而比較常見的容易致癌的hpv類型有26、53、66等。引起扁平疣的HPV主要爲HPV3或10，少數爲28、29和41，均爲低危類型，一般不癌變。
1、影響外觀
扁平疣常常會出現在人體比較暴露的部位，如面部、手背等位置。扁平疣的發病初期會在患者的皮膚表面出現淡褐色的丘疹，隨着病情的發展，丘疹的顏色逐漸變深。因此扁平疣的發生嚴重影響了患者的整體形象。一些扁平疣患者會因與理想的工作擦家而過，從而影響患者的個人發展前途。
2、傳染性
扁平疣具有很強的傳染性，而這將會嚴重影響患者的日常交往。比如一些患者會因扁平疣所具有的傳染性而在與別人交往中感到十分的尷尬。一方面會擔心別人歧視自己，另一方又擔心會將扁平疣傳染給其他的人，這使得患者和身邊的人產生了隔閡。
3、身體不適
患得扁平疣首先會讓患者自身感覺非常難受。因爲扁平疣的主要症狀之一就是癢，若瘙癢加重，疣的數目突然增加、色紅、鼓起，這更易傳染，切忌搔抓，就注意及時治療。
1、皮膚低危型：包括HPV-1、2、3、4、7、10、12、15等與尋常疣、扁平疣、跖疣等相關;
2、皮膚高危型：包括HPV-5、8、14、17、20、36、38與疣狀表皮發育不良有關，其他還與可能HPV感染有關的惡性腫瘤包括：外陰癌、陰莖癌、肛門癌、前列腺癌、膀胱癌;
3、黏膜低危型：如HPV-6、11、13、32、34、40、42、43、44、53、54等與感染生殖器、肛門、口咽部、食道黏膜;
4、黏膜高危型：HPV-16、18、30、31、33、35、39與宮頸癌、直腸癌、口腔癌、扁桃體癌等。
臨牀上常見的乳頭瘤或生殖器溼疣，90%是HPV6和11型感染。
