1、化腦預後嚴重，應力求用藥24小時內殺滅腦脊液中致病菌，故應選擇對病原菌敏感，且能較高濃度透過血腦屏障的藥物。
2、急性期要靜脈用藥，做到用藥早、劑量足和療程夠。
1、病原菌明確前的抗生素選擇：
包括診斷初步確立但致病菌尚未明確，或院外不規則治療者。應選用對肺炎鏈球菌、腦膜炎球菌和流感嗜血桿菌三種常見致病菌皆有效的抗生素。目前主要選擇能快速在患者腦脊液中達到有效滅菌濃度的第三代頭孢菌素，包括頭孢噻肟，或頭孢三嗪，療效不理想時可聯合使用萬古黴素。對β內酰胺類藥物過敏的患兒，可改用氯黴素。
2、病原菌明確後的抗生素選擇：
①肺炎鏈球菌由於當前半數以上的肺炎球菌對青黴素耐藥，故應繼續按上述病原菌未明確方案選藥。僅當藥敏試驗提示致病菌對青黴素敏感，可改用青黴素。
②腦膜炎球菌與肺炎鏈球菌不同，目前該菌大多數對青黴素依然敏感，故首先選用，劑量同前。少數耐青黴素者需選用上述第三代頭孢菌素。
③流感嗜血桿菌對敏感菌株可換用氨苄西林。耐藥者使用上述第三代頭孢菌素聯合美羅培南，或選用氯黴素。
④其他致病菌爲金黃色葡萄球菌者應參照藥敏試驗選用萘夫西林、萬古黴素或利福平等。革蘭陰性桿菌者除考慮上述第三代頭孢菌素外，可加用氨苄西林或美羅培南。
對肺炎鏈球菌和流感嗜血桿菌腦膜炎，其抗生素療程應是靜脈滴注有效抗生素10～14天，腦膜炎球菌者7天，金黃色葡萄球菌和革蘭陰性桿菌腦膜炎應21天以上。若有併發症，還應適當延長。
抗生素使用注意事項
1、只有病原菌對藥物敏感與不敏感之分：抗生素不應該以價格爲判斷標準，抗生素無高級與低級之分，以價格的高低來判斷藥物的好壞和級別是錯誤的。而應該聽從醫囑根據寶寶的症狀及有關化驗結果合理選用抗生素。
2、用些抗病毒的藥就可以了：辨明症狀再用一般的傷風感冒，只要不合並細菌感染，爸媽就不要隨便給寶寶服用抗生素。
3、療程要依照寶寶感染的輕重程度來決定：不要隨意換藥抗生素的用量，爸媽切記不要頻繁換藥，一種藥物起效往往需要一定的時間，隨意換藥不僅達不到治療效果，還會使細菌產生耐藥性，延誤治療。
4、對某種物質過敏而引起的炎症不能使用抗生素：如過敏性皮炎、過敏性鼻炎等，也同樣不是細菌感染引起的炎症，這時使用抗生素不僅無效，反而會引起新的過敏反應。
5、不可隨意使用抗生素：有些藥物如紅黴素、阿奇黴素等大環內酯類藥物對腸胃有副作用，要飯後服用，可以用食物減少藥物對腸胃的刺激。如果寶寶是靜脈點滴注射，儘量安排在飯後，或者點滴期間，吃一些小餅乾和點心。
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