包括髮熱、煩躁不安和進行性加重的意識障礙。隨病情加重，患兒逐漸從精神萎靡、嗜睡、昏睡、昏迷到深度昏迷。約30%以上患兒有反覆的全身或侷限性驚厥發作。腦膜炎雙球菌感染常有瘀癍、瘀點和休克。
包括頭痛、嘔吐，嬰兒則有前囟飽滿與張力增高、頭圍增大等。合併腦疝時，則有呼吸不規則、突然意識障礙加重或瞳孔不等大等體徵。
以頸強直最常見，其他如克氏徵和布氏徵陽性。
多不典型，主要差異在：
（1）體溫可高可低，或不發熱，甚至體溫不升；
（2）顱壓增高表現可不明顯。幼嬰不會訴頭痛，可能僅有吐奶、尖叫或顱縫開裂；
（3）驚厥可不典型，如僅見面部、肢體局竈或多竈性抽動、局部或全身性肌陣攣、或呈眨眼、呼吸不規則、屏氣等各種不顯性發作；
（4）腦膜刺激徵不明顯。與嬰兒肌肉不發達，肌力弱和反應低下有關。
檢查事項
1、腦脊液檢查：
是確診本病的重要依據。典型病例表現爲壓力增高，外觀混濁似米湯樣。白細胞總數顯著增多，≥1000×10/L，但有20%的病例可能在250×10/L以下，分類中性粒細胞爲主。糖含量常有明顯降低，蛋白顯著增高。
確認致病菌對明確診斷和指導治療均有重要意義，塗片革蘭染色檢查致病菌簡便易行，檢出陽性率甚至較細菌培養高。細菌培養陽性者應送藥物敏感試驗。以乳膠顆粒凝集法爲基礎的多種免疫學方法可檢測出腦脊液中致病菌的特異性抗原，對塗片和培養未能檢測到致病菌的患者診斷有參考價值。
2、其他：
（1）血培養對所有疑似化腦的病例均應作血培養，以幫助尋找致病菌。
（2）皮膚淤斑、瘀點找菌是發現腦膜炎雙球菌重要而簡便的方法。
（3）外周血象白細胞總數大多明顯增高，中性粒細胞爲主。但在感染嚴重或不規則治療者，有可能出現白細胞總數的減少。
（4）血清降鈣素原可能是鑑別無菌性腦膜炎和化腦的特異和敏感的檢測指標之一，血清降鈣素原>0.5ng/ml提示細菌感染。
（5）神經影像學頭顱MRI較CT更能清晰地反映腦實質病變，在病程中重複檢查能發現併發症並指導干預措施的實施。增強顯影能顯示腦膜硬化等炎症改變。
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