少量積液無需處理。如積液量較大引起顱壓增高症狀時，應作硬膜下穿刺放出積液，放液量每次每側不超過15ml。有的患兒需反覆多次穿刺，大多逐漸減少而治癒。個別遷延不愈者，需外科手術引流。
進行側腦室穿刺引流，以緩解症狀。同時，針對病原菌並結合用藥安全性，選擇適宜抗生素腦室內注入。
主要依賴手術治療，包括正中孔粘連鬆解、導水管擴張和腦脊液分流術。
1、本病嬰幼兒死亡率10%。肺炎球菌腦膜炎、患兒年齡4天者死亡率較高。
2、10%～20%的倖存者遺留各種神經系統嚴重後遺症，常見的神經系統後遺症包括聽力喪失、智力倒退、癲癇、語言能力延遲、視力障礙、行爲異常等。
3、化腦預後好壞與是否早期明確病原菌，選擇恰當的抗生素進行治療密切相關。經腦脊液檢查初步確診後，應儘快由靜脈給予適當、足量的抗生素，以殺菌藥物爲佳，並根據病情按計劃完成全部療程，不可減少藥物劑量與改變給藥方法。
4、始終不能明確病原菌者，多由於診斷未明時曾不恰當使用抗生素所致。如在流腦流行季節，年長兒童一般應先考慮系腦膜炎雙球菌所致，如有瘀點、瘀斑則更可疑。可先用青黴素、氨苄青黴素、磺胺治療，再根據反應高速用藥。
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