應慎用。
口服奧美拉唑腸溶膠囊後，經小腸吸收，1小時內起效，0.5～3.5小時血藥濃度達峯值，作用持續24小時以上，可分佈到肝、腎、胃、十二指腸、甲狀腺等組織，且易透過胎盤，通過血液輸送到胎兒體內，對胎兒有不良反應，如致畸或使胚胎致死等。所以，奧美拉唑的說明書也註明了，孕期、哺乳期婦女慎用。
1、一些人使用奧美拉唑後會出現口乾、輕度噁心、嘔吐、腹脹、便祕、腹瀉、腹痛等不適症狀;丙氨酸氨基轉移酶(ALT)、天門冬氨酸氨基轉移酶(AST)和膽紅素升高也有發生，一般是輕微和短暫的，大多不影響治療。
2、較長時間服用或誤服大量此藥時可發生中毒，主要表現如下：
(1)對肝臟的影響：可有一過性血清轉氨酶和鹼性磷酸酶升高。
(2)對腎臟的損害：有蛋白尿、尿素氮和肌酐升高，偶有間質性腎炎或腎衰竭。
(3)神經系統症狀：頭痛、耳鳴、嗜睡、焦慮、抑鬱，部分病人發生周圍神經病變，而感到指端麻木。
(4)呼吸道症狀：個別病人可發生咳嗽、哮喘、急性肺水腫。
(5)心血管系統症狀：心動過緩(或心動過速)、右束支傳導阻滯。
(6)血液方面：白細胞和血小板減少，甚至全血細胞減少及溶血性貧血表現。
(7)其他：偶見視力障礙、亞急性肌炎、進行性肌無力和站立行走困難。
一般來說，使用奧美拉唑出現一般不良反應時，停藥後大多能自行逐漸恢復。但若發現中毒症狀，應立即就醫對症治療。
除了孕產婦要慎用奧美拉唑外，嚴重腎功能不全者、嬰幼兒和對奧美拉唑過敏者都不能用此藥。
