遺傳學是引起習慣性流產的男性因素中的一個方面，其中男性染色體異常，發生平衡易位，就可以導致妻子流產。
男性染色體異常導致女性習慣性流產。我們知道，人類的細胞中有23對(46條)染色體，正常人在形成生殖細胞時，初級精母細胞和初級卵母細胞必須經過減數分裂，使46條染色體一分爲二，所以每個精子和卵子只含23條染色體。受精後，精卵融爲一體，來自父母雙方的23條染色體又結合成23對，形成正常的胚胎。在有染色體易位的情況下，這種分配就會出現不均勻，異常的精子與正常卵子結合後就會形成異常的三體或單體受精卵(正常爲雙體)。
單體形式的受精卵往往在胚胎髮育早期就夭折，造成流產或死胎;三體形式的受精卵也很容易發生流產，即便能勉強活到出生，也一定是個先天性畸形兒，很難長大，或發育成爲低能兒。
近年來，隨着醫學遺傳學工作的開展，染色體檢查技術的日益普及，已越來越多地發現，某些反覆流產的原因是由於染色體不正常，並且雙方不論誰的染色體異常，均可造成流產。染色體平衡易位的患者可是男的，也可是女的。這種攜帶者在人羣中約佔0.2%，即250對正常夫婦中就有一個攜帶者。但在發生過自然流產史的人羣中，攜帶者佔5%，這些人婚後生育時，可能會出現死胎、死產、流產和畸形兒等。
