啓脾丸的副作用尚不明確。
啓脾丸主要由人蔘、白朮(炒)、茯苓、甘草、陳皮、山藥、蓮子(炒)、山楂(炒)、六神曲(炒)、麥芽(炒)、澤瀉等製作而成，屬於中成藥，一般來說副作用是很小的，只要按照醫囑或是說明書使用是不會出現副作用的。 正確的用藥，合理的用藥是治療疾病關鍵的一步。大家應該保持良好的生活習慣和飲食習慣。如果服用啓脾丸7天后症狀沒有緩解就應該及時就醫了。
1.忌生冷油膩及不易消化食物。
2.嬰幼兒應在醫師指導下服用。
3.感冒時不宜服用。
4.長期厭食、體弱消瘦者，及腹脹重、腹瀉次數增多者應去醫院就診。
5.服藥7天症狀無緩解，應去醫院就診。
6.對本品過敏者禁用，過敏體質者慎用。
7.本品性狀發生改變時禁止使用。
8.兒童必須在成人監護下使用。
9.請將本品放在兒童不能接觸的地方。
10.如正在使用其他藥品，使用本品前請諮詢醫師或藥師。
