華佗再造丸飯前還是飯後吃沒有明確規定，可以遵醫囑服用。
正確的服藥時間應根據病情來決定。病在上焦的(心、肺部)，欲使藥力停留較久，宜飯後服;病在下焦的(膀胱、腸)，欲使藥力迅速下達，宜飯前服;清熱解毒藥、潤腸瀉下藥、滋補藥宜空腹服，此時胃中空虛容易吸收。所謂空腹服即指早飯前一小時或晚飯後一小時服藥。
建議華佗再造丸：口服。一次4-8克，一日2-3次;重症一次8-16克;或遵醫囑。
1.治療腰椎骨質增生
用法：內服華佗再造丸，每次10克，每天3次，溫開水送服，10天爲一個療程，連續服藥至痊癒爲止。在服本藥時，停服其他中西藥物。
療效：用華佗再造丸治療腰椎骨質增生患者93例，其中一個療程治癒者21例，2個療程治癒者30例，3個療程治癒者25例;有效者10例，無效者7例。總有效率92.47%。治療過程中極少有不良反應發生。治癒的76例中，經隨訪1～2年，均未見覆發。
2.治療頑固性偏頭痛
用法：內服華佗再造丸，每次8克，每天3次，溫開水送服，7天爲一個療程。
療效：在68例頑固性偏頭痛患者中，經用藥1～2個療程後，治癒者61例，佔89.71%;有效者5例，佔7.35%;無效者2例，佔2.94%;總有效率爲97.06%。一般用藥3～5天后即可收到明顯的效果。
3.治療精液不液化所致男性不育症
療效：治療精液不液化所致男性不育症患者65例，30天爲一療程，獲滿意效果。65例中，治癒者54例，治好比例83.1%，其中妊娠者25例，妊娠率38.5%。在治癒的病例中，經用藥一個療程治癒者38例，2個療程治癒者16例。
