早產兒發生腦膜炎或者敗血症的機率遠遠高於正常的寶寶，這主要是因爲早產兒血清免疫球蛋白水平明顯低下，發生感染的機率也會大大的增加。另外，早產兒還容易出現壞死性小腸結腸炎這種疾病。
一般早產兒在剛出生的1-2個月，會存在不同程度的貧血。由於血管暴露在皮膚表面，貧血肉眼不容易看到。這主要是因爲早產兒發育太快以及鐵儲存不足，需要的血量就會增加，但是造血功能比較差，就很容易出現貧血的症狀。
早產兒腦室周圍胚胎容易出現出血的情況，有可能會引起腦室內出血的發生。如果出血不嚴重的話，且沒有造成腦室擴大，大多數都會自行吸收的。但是如果大量出血，造成腦組織或者腦室擴大，都有可能會神經功能造成一定的影響，從而導致動作發展遲緩或者行爲障礙的發生。
早產兒的腎臟功能並不成熟，對尿的稀釋和濃縮功能比正常寶寶差，高蛋白質配方奶餵養很容易引起固定酸的積聚，如果腎臟排泄固定酸能力不足，很容易引起遲發性代謝性酸中毒和生長遲緩的發生。
