參保兒童在指定的醫院住院治療疾病，所產生的基本治療費用。
血友病、再生障礙性貧血、白血病、惡性腫瘤、器官移植(七類)，器官移植範圍包括：腎臟、皮膚、血管、心臟瓣膜、角膜、骨和骨髓移植。
1、住院起付標準：
參保兒童在市內一級醫院或者是一級以下的醫院就診的話，起付線爲300元；
參保兒童在市內二級醫院就診的話，起付線爲400元；
參保兒童在市內三級醫院就診的話，起付線爲500元；
參保兒童在市外醫院就診的話，起付線爲600元。
2、大病報銷標準：
參保兒童在門診治療疾病的話，門診大病費用是沒有起付線制度的。如果參保兒童每次住院發生的起付線以上的基本醫療費用，只要是在一個年度最高限額內，花費5000元以下部分，少兒醫療保險是可以報銷百分之八十；花費在5000元-10000元部分，少兒醫療保險是可以報銷百分之八十五；花費在10000元以上部分，少兒醫療保險是可以報銷百分之九十。一個年度的最高限額爲20萬元，但是是要在連續參保4年以上的情況下才有這麼高的限額。
1、一檔：
申請人須同時滿足以下條件，纔可以申請報銷深圳基本醫保一檔內地急診住院費用：
（1）申請人已經辦理參保手續、足額繳交醫療保險費，參保時間已經是次月的1日；
（2）參保人蔘加的是深圳基本醫療保險一檔；
（3）參保人在備案醫療機構就醫發生了住院醫療費用，並先行支付現金，且保存有關單據和資料。
2、二檔：
申請人須同時滿足以下條件，纔可以申請報銷深圳基本醫保二檔內地急診住院費用：
（1）申請人已經辦理參保手續、足額繳交醫療保險費，參保時間已經是次月的1日；
（2）參保人蔘加的是深圳基本醫療保險二檔；
（3）參保人在備案醫療機構就醫發生了住院醫療費用，並先行支付現金，且保存有關單據和資料。
3、三檔：
深圳基本醫療保險三檔參保人符合以下條件之一的，可申請基本醫療保險三檔(農民工醫療保險)參保人住院費用現金報銷：
（1）基本醫療保險三檔參保人因工外出或出差，在非農民工醫療保險定點醫療機構因急診搶救發生的住院費用現金報銷；
（2）基本醫療保險三檔參保人未按規定辦理轉診手續，自行到非農民工醫療保險定點醫療機構就醫發生的住院費用現金報銷。
報銷材料
1、原始收費收據原件(一份)
2、費用明細清單原件(一份)
3、門診病歷原件＋複印件(一份)
4、疾病診斷證明書原件1份
注意：急診住院須出具醫院急診證明
5、社會保障卡原件＋複印件(一份)
社保卡須是申請人本人的。
6、身份證原件＋複印件(一份) 申請人自己辦理須提交本人身份證明；委託他人代辦的應當提供代辦人身份證。
7、銀行賬戶原件＋複印件(一份)
任意一樣：銀行存摺或銀行卡
（1）銀行賬戶須是申請人本人賬戶；
（2）銀行賬戶開戶銀行須爲深圳工商銀行、建設銀行、農業銀行、中國銀行其中一所銀行。
1、普通門診：
就醫前需先選定本市一家社康中心(14週歲及以下的基本醫保二檔參保人可選一家社康中心或一家市內二級以下醫院)。自選定生效或變更生效次月起方可享受相應待遇。
2、大病門診：
就醫或門診輸血可選定市內任意一家定點醫療機構就醫。
3、轉診：
在綁定的定點醫療機構門診就醫時，需要轉診的，應經原結算醫院同意。轉診應逐級轉診或轉診到市內同級有專科特長的醫療機構，由本人先行支付後憑有關單據和資料到結算醫院或指定的醫療機構申請審覈報銷。未辦理轉診手續到結算醫院外的其它定點醫療機構住院就醫，待遇降至原支付標準的90%。
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