試管嬰兒也可能會出現宮外孕，這是因爲移植入宮腔的胚胎有時會隨培養液流入輸卵管，當輸卵管功能正常時，能將胚胎在運送回宮腔，但當輸卵管和盆腔病變後，輸卵管正常蠕動消失，就不能將胚胎運送回宮腔，就會發生宮外孕。
做試管嬰兒時，如果胚胎質量差、移植胚胎數目多、患有子宮內膜異位症等都會導致宮外孕發生率增高。
另外，試管嬰兒胚胎移植時移植管放入宮腔的深度、移植管內的液體量、移植時注入的速度、移植胚胎數目的多少、移植後患者的體位等都可能造成宮外孕。
1、藥物治療
治療方法：主要是用藥物進行治療，要在確診爲宮外孕的情況下采用藥物的方式，致使孕囊枯萎，隨後便排除體外。
適用人羣：適用於早期異位妊娠，要求保存生育能力的年輕患者。輸卵管妊娠包塊直徑<3cm，未發生破裂或流產，無明顯內出血，血HCG<2000U/L者。
注意：宮外孕藥物治療也會存在一定風險的，因爲萬一藥物沒有殺死胚胎，就會使胚胎越長越大，就有可能會出現輸卵管破裂大出血，甚至會發生危及宮外孕女性生命的可能。所以，治療方式的選擇一定要慎重。
2、手術治療
對於輸卵管未破裂或輸卵管破口不大的宮外孕，通過腹腔鏡手術，切開輸卵管，去處胚胎，然後縫合，保持輸卵管的功能，這是現今宮外孕治療方法中的一種。
對輸卵管破裂嚴重很難修復且伴失血性休克者，只能腹腔鏡或開腹切除患側輸卵管，並可能需要輸血。
試管嬰兒爲很多不孕不育的家庭帶來了福音，也是目前較爲理想和成熟的人工生育手段，但也有不成功的病例，比如宮外孕。所以，做試管嬰兒的女性朋友應選擇專業的醫院、由經驗豐富的醫生實施試管嬰兒手術，最大程度的減少和避免宮外孕的發生，從而保證試管嬰兒成功妊娠。
