爲了提高試管嬰兒的受孕率，很多女性朋友是要進行促排卵治療的，一般來說，女性每個月只排一個卵，而這種治療是讓女性朋友一次排出很多卵，這樣會容易造成女性朋友內分泌紊亂，甚至是月經失調。
做試管嬰兒，對女性影響更多的是心理壓力，因爲試管成功的關鍵因素還是女性的卵子和子宮環境，所以試管治療中女性要承受更多的心理和精神負擔，她們擔心試管失敗了，生育計劃再一次落空，害怕面對家人失望的神情。所以很多時候試管對女性的傷害並不是試管本身，而是她們的心理壓力。
使用促排卵激素最大的副作用很加速卵巢的衰老，很多女性使用之後會出現臉上長黑斑、皺紋等現象，甚至會誘發子宮癌、卵巢癌等危險。年輕女性於40歲以前閉經、卵巢不敏感綜合徵，成人呼吸窘迫綜合徵等等。
由於治療手段的需要，試管嬰兒多胎率比較高，很多女性一下會懷上多胞胎，這加重了生產時的負擔，並且在妊娠期間女性也會比正常受孕的要痛苦許多。
