藥物流產若是沒流乾淨，宮腔內還有殘留的妊娠組織，患者會出現如下症狀：
1、陰道內有淋漓不盡的出血情況，出血時間長達2周以上。
2、藥流成功的孕囊排出後腹痛就會明顯減輕，之後會逐漸消失，但若是患者回家後還時常出現有持續性的腹部疼痛感，就可能是沒排乾淨。
3、有些患者還會出現發熱、噁心等不適症狀，流血有異味，這是妊娠組織沒排乾淨導致宮腔感染髮炎所致。
有上述症狀的患者應就醫檢查做超聲檢查，可看到宮腔內殘留物或者子宮內膜回聲不均勻，這需要進一步處理。
應先做超聲檢查查看宮腔內的殘留組織大小。若是體積較小，低於1釐米且日常出血量少，可服用一些排淤血的藥物幫助其排出體外，同時服用消炎藥，避免感染。
如果殘留物超過1cm，則必須做清宮手術取出。
藥流的女性服用米索前列醇後，腹痛並見到有孕囊排出，且等孕囊排出後腹痛明顯減輕，陰道流血量暫時稍微增多。之後隨着時間推移出血量一天比一天少，一週左右就沒了，就說明藥流流乾淨了。等2周後去醫院做超聲複查，結果正常的可完全確定藥流成功。
