本病的潛伏期一般爲1～3日(數小時至4天)。臨牀上可有急起高熱，全身症狀較重而呼吸道症狀並不嚴重，表現爲畏寒、發熱、頭痛、乏力、全身痠痛等。體溫可達39～40oC，一般持續2～3天后漸退。全身症狀逐漸好轉，但鼻塞、流涕、咽痛、乾咳等上呼吸道症狀較顯著，少數患者可有鼻衄、食慾不振、噁心、便祕或腹瀉等輕度胃腸道症狀。體檢病人呈急病容，面頰潮紅，眼結膜輕度充血和眼球壓痛，咽充血，口腔粘膜可有皰疹，肺部聽診僅有粗糙呼吸，偶聞胸膜摩擦音。症狀消失後，仍感軟弱無力，精神較差，體力恢復緩慢。
(一)肺部併發症可有以下三種類型
1.原發性病毒性肺炎本病較少見，是1918～1919年大流行時主要原因。多見於原有心、肺疾患者(特別是風溼性心臟病、二尖瓣狹窄患者)或孕婦。肺部病變以漿液性出血性支氣管肺炎爲主，有紅細胞外滲、纖維滲出物和透明膜形成。臨牀上有高熱持續不退、氣急、紫紺、陣咳、咯血等症狀，體檢發現雙肺呼吸音低，滿布哮鳴音，但無實變體徵。病程可長達3～4周，血白細胞計數低，中性粒細胞減少。X線檢查雙側肺部呈散在性絮狀陰影。患者可因心力衰竭或周圍循環衰竭而死亡。痰與血培養均無效，病死率較高。
2.繼發性細菌性肺炎以單純型流感起病，2～4日後病情加重，加度增高並有寒戰，全身中毒症狀明顯，咳嗽增劇，咳膿痰，伴有胸痛。體檢可見患者呼吸困難，紫紺，肺部滿布羅音，有實變或局竈性肺炎徵。白細胞和中性粒細胞顯著增高，流感病毒不易分離，但在痰液中能找到致病菌，以金黃色葡萄球菌、肺炎球菌和嗜血桿菌爲多見。
3.病毒與細菌混合性肺炎流感病毒與細菌性肺炎同時並存，起病急，高熱持續不退，病情較重，可呈支氣管肺炎或大葉性肺炎，除流感抗體上升外，也可找到病原菌。
(二)肺外併發症
‘s綜合徵系甲型和乙型流感的肝臟、神經系統併發症，也可見於帶狀皰疹病毒感染。本病限於2～16歲的兒童，因與流感有關，可呈暴發流行。臨牀上在急性呼吸道感染退數日後出現噁心、嘔吐、繼而嗜睡、昏迷、驚厥等神經系統症狀，有肝腫大，但無黃疸，腦脊液檢查正常，無腦炎徵，血氨增高，肝功能輕度損害，病理變化腦部僅有腦水腫和缺氧性神經細胞退行性變，肝細胞有脂肪浸潤。病因不明，近年來認爲與服用阿司匹林有關。
2.中毒性休克綜合徵多在流感後出現，伴有呼吸衰竭，胸片可顯示成人呼吸窘迫綜合徵，但肺炎病變不明顯。血液中可有流感抗體上升，氣管分泌物可找到致病菌，以金黃色葡萄球菌爲多見。
3.橫紋肌肌溶系局部或全身骨骼肌壞死，表現爲肌痛和肌弱，血清肌酸磷酸酶升高和電解質混亂，可有急性腎功能衰竭。
