巧克力囊腫主要是由於月經期子宮壁脫落的子宮內膜碎片因引流不暢，不能全部從陰道排出，有少量經輸卵管向盆腔倒流。凡是能影響月經血從陰道流出的，包括陰道閉鎖、子宮頸口狹小、子宮後傾、多次人工流產後子宮頸口粘連、月經期性交等，都能促發生巧克力囊腫。
每月卵巢內沒有受精的卵泡成爲廢品垃圾也要排泄出去，必須靠體內液壓把這些垃圾擠出來，由於你機能減退，加上輸卵管有堵塞現象，垃圾排不出來，排不出去的卵子堆積在卵巢內，就形成了巧克力囊腫。
壓力過大這是造成卵巢巧克力囊腫的主要原因，長期的精神壓力過大、會引起植物神經功能紊亂、影響人體內分泌調節，以致卵巢功能過早衰退，雌激素的分泌減少，使更年期提前到來。
女性的子宮內膜在正常的情況下面是在宮腔之中生長的，隨着每個月女性生理期的到來，其會剝落之後重新開始增厚生長。但是由於內膜開始在女性的卵巢進行生長，但是在生理期的時候這一部分的內膜並不會隨着離開自己的，而是在卵巢的位置淤積，隨着長在卵巢位置的內膜不斷增厚，淤積的內膜會越來越多，使得卵巢的位置出現了囊腫。
很多女性朋友都是由於生活環境的污染，比如空氣中經常有刺激性的氣味或者是塵埃，或者是噪音過大，以及生活在化學成分比較濃的環境中時，都有可能會導致女性出現卵巢囊腫。
臨牀上很多卵巢囊腫和多囊卵巢綜合症患者的基本病理生理改變是卵巢產生過多雄激素，而雄激素的過量產生是由於體內多種內分泌系統功能異常協同作用的結果。
臨牀上80%的子宮內膜異位症發生與卵巢生髮上皮的化生潛能有關，但目前很多學者認爲腹膜刺激合併子宮內膜異位症是果而不是因，而且腹膜刺激都發生在異位竈以外的部位。
生活習慣不好、飲食壞習慣、心理壓力過大等因素造成體質過度酸化，人體整體的機能下降，引起腎虛，肝腎同源，腎卵巢囊腫病理虛肝亦虛，進而引起下焦代謝循環變慢，造成卵巢疾病和內分泌失調，免疫功能下降，從而發展爲卵巢組織異常增生,終致卵巢囊腫，甚至癌變。
巧克力囊腫的病因有很多，其中很大一部分病因是因爲一些生活中的壞習慣以及不良的環境造成的，所以大家一定要遠離對身體不好的環境、糾正以前的一些不良嗜好以及增加適當的運動，做到這幾點相信疾病都會離你遠去的哦!
