新生兒腦癱不能通過核磁共振檢查出來，因爲核磁共振並不能確診，只能通過多次對比發現其中異常，而且會根據個人體質差異有不同的結果，有些能看出異常，有些就不能。
這時候就是還需要配合做電生理檢測，腦功能檢測等，並結合臨牀症狀來進行確診，及時對症治療。
如果進行檢查的話，建議到正規的醫院就診，而且很多藥物的話不能夠直接滲透到血腦屏障，不能產生直接的藥效作用，需要利用康復鍛鍊來提高腦癱患兒的模仿能力，改善部分運動能力等。
核磁共振是一種排查顱腦發育畸形的檢查方式，新生兒時期就可以做的，很多醫生會在寶寶黃疸指數高的時候用來檢查寶寶發育情況。
核磁共振檢查適用於顱腦發育畸形排查，各類外傷，腫瘤，各種炎症，寄生蟲感染，各種腦血管病變如出血，梗塞，血管畸形，動脈瘤血管瘤等，遺傳性疾病，腦代謝疾病，繼發性癲癇病等等。
如果寶寶有神經系統症狀，考慮是顱內疾病所致，那首選的檢查就是頭顱核磁共振檢查了。
新生兒腦癱治療方法是需要檢查之後，通過臨牀症狀來不斷完善治療方案的。
新生兒腦癱如果是出現了肢體活動發育較差，可以通過肢體功能恢復訓練進行治療，其中包括被動活動治療，以及機械治療和鍼灸治療以及按摩治療。
如果是腦發育不良可以採取藥物治療，主要是應用營養腦細胞的藥物，營養腦神經的藥物進行治療。
如果病情比較嚴重的情況下，可以進行外科手術治療，所以新生兒腦癱疾病治療並不代表完全的治癒，但是治療肯定能夠有效的改善腦癱的症狀。
