胎糞進入胎兒體內後，會阻塞寶寶的呼吸道，吸氣時空氣尚能穿透沾滿胎糞的氣管，但呼氣時卻很艱難，因此導致呼吸困難，導致胎兒出現缺氧的情況，若及時得到改善對胎兒沒有後遺症。但若是治療不及時可能因缺氧而影響胎兒大腦發育，甚至導致胎兒發育畸形或失聰，嚴重的甚至會導致胎兒死亡，其病死率居於10%。
當胎兒發生宮內窘迫時，會導致腸壁缺血痙攣，肛門括約肌因放鬆而排出胎糞污染羊水。胎兒缺氧時會先呼吸暫停，然後大喘氣。含有胎糞的羊水被吸入呼吸道中，引發呼吸道感染、肺部發炎等一系列症狀，而這被稱爲“胎糞吸入綜合徵”。
胎糞吸入綜合徵多見於足月兒和妊娠期過長的胎兒，這類胎兒出生後，醫生會通過體檢發現一些胎糞吸入的症狀，包括：
症狀一：呼吸窘迫。表現爲呼吸急促、困難甚至暫停。
症狀二：皮膚。皮膚顏色並非健康的粉紅色，而呈黃綠色，是胎糞污染所致。
症狀三：指甲。指甲的顏色也呈現黃綠色，另外妊娠期過長的胎兒指甲會比較長。
症狀四：羊水。羊水中有胎糞。
症狀五：阿普加評分較低。膚色、心率、對刺激的反應、肌張力、呼吸這五項的得分在及格以下。
病情較輕的寶寶沒有表現出明顯的呼吸困難，而較重的寶寶有氣促、呼吸困難、極度的煩躁、呻吟等症狀，此時應及早治療。
