附睾炎常由泌尿系前列腺炎和精囊炎的致病菌沿輸精管蔓延到附睾所致,常見致病菌有大腸桿菌、沙眼衣原體等。
尿液返流尿液可返流入精囊腺內,無菌尿返流可導致尿液進入射精管,導致化學性附睾炎,還可繼發於前列腺炎或尿路感染。
手術感染前列腺摘除術後尿中可能帶菌8-12周,在排尿時尿液返流進入射精管內,引起逆行感染而導致附睾炎;感染也可通過周圍淋巴管侵入附睾。
流行性腮腺炎約20%腮腺炎患者會併發睾丸炎和附睾炎。這是因爲腮腺炎病菌細菌侵犯有活性的腺體,而睾丸爲男性的性腺體,活性強,所以會因腮腺炎而引起附睾炎。