男性睪丸受到毒藥或者重金屬的侵襲，會被損害，有時會發生睪丸縮小情況。
男性睪丸在外傷或手術時受到損傷，傷了睪丸的動脈、血管、神經等部位，就會導致睪丸的血液供應不足，從而出現睪丸變小、萎縮的情況。
精索是睪丸聯絡人體的橋樑，如果罹患精索靜脈曲張症，睪丸的血液迴圈會受到干擾，發生淤血、缺氧，以及有害物質在睪丸內積聚，睪丸就會變小、萎縮。
如小朋友出現腮腺炎，腮腺炎的病毒既會感染腮腺，也會感染睪丸，這時會出現睪丸的萎縮、變小，此時應該到醫院進行診斷治療，以免導致長大後出現不孕不育的風險。
炎症
重度睪丸炎發病時睪丸腫脹、疼痛，可以持續多日。由於細菌的侵犯而造成睪丸組織破壞，導致睪丸組織發生萎縮，變小。
睪丸是一種內分泌器官，主要產生雄激素，而體內許多指揮內分泌的器官，如腦垂體、腎上腺、丘腦下部等出現疾病，都會干擾睪丸的功能，引起睪丸變小，萎縮。
