小兒發病初期出現類似感冒的症狀，如發熱、咳嗽、流鼻涕、噁心、嘔吐等，發熱情況可持續4到5天。
之後會隨之出現口腔黏膜疹，起初爲粟米樣斑丘疹或水皰，周圍有紅暈，一般無疼痛及癢感，痊癒後不留痕跡。除此之外，口腔內會有疼痛的潰瘍，導致吞嚥困難，食慾減退;手足等遠端部位出現或平或凸的斑丘疹或皰疹，皮疹不癢，斑丘疹在5天左右由紅變暗，然後消退。
注意：少數病例，特別是EV71感染患兒，可出現腦膜炎、腦炎、腦脊髓炎、神經源性肺水腫、循環障礙等，病情兇險，可致死亡或留有後遺症。
小兒手足口病潛伏期爲2-10天，平均3-5天，病程一般爲7-10天。
手足口病全年都可發生其中6～8月份爲手足口病發病高峯。根據國內外報道，每隔2～3年流行1次，患手足口病的人羣以4～5歲以下小兒爲主。孩子上學的時候還會出現一次小高峯，建議家長千萬要注意孩子衛生，那疾病就可以得到一定的預防。
手足口病是可防可控疾病，家長和孩子應牢記預防手足口病“勤洗手，喝開水，吃熟食，勤通風，曬衣被”的15字訣。
絕大多數患兒預後良好，出現重症表現的患兒是少數。大多數手足口病患者一般在1～2周內痊癒，不會留下後遺症。極少數患者可有併發症，病情嚴重，甚至引起死亡。
