若男性少精是因生殖系統感染髮炎所致，則應服用一些抗菌消炎類藥物。比如氟羅沙星、阿奇黴素、阿莫西林、氟哌酸或磺氨類藥物等。這類患者應根據細菌培養和藥敏試驗選用合適的抗菌消炎藥。
若少精是因自身免疫產生抗精子抗體的男性，則可試用免疫抑制劑，如腎上腺糖皮質激素類藥物及大劑量維生素C治療。
若患者是因內分泌異常引起的少精，則應吃些調理分泌的藥物， 比如促進雄性分泌的藥物銼甲雙酮片，它可促進睾丸分泌。
腎虧腎虛引起的少精，應服用調理腎臟的藥物。比如六味地黃丸，壯筋補腎丸等。
補充鋅硒等微量的藥物
男性缺鋅會使性激素分泌減少，從而使性功能不全、睾丸縮小，從而影響精子的生成、成熟，最終導致精子數目減少、活力下降、精液液化延遲。所以這類患者可服用補充鋅硒等微量的藥物，比如鋅硒咀嚼片、育之緣片等。
對於病因不明的特發性少精子症，可以採用睾酮或人工合成睾酮衍生物治療，如丙酸睾丸酮、氟羥甲睾酮等。5-羥色胺拮抗劑Metergoline也有一定療效。另外可以試用糖皮質激素、克羅米芬、他莫西芬、人絨毛膜促性腺激素(HCG)、人絕經期促性腺激素(HMG)等藥物。
