百日咳恢復期的時候一般是可以接種疫苗的，如果孩子的百日咳病毒已經被消滅，現在只有部分的病毒蛋白在體內引起的恢復期反應，這種情況下是可以進行育苗的接種的。
百日咳的疫苗主要分爲以下三種，目前我國常用的是使用百白破疫苗。
百日咳疫苗有良好預防效果，是最先納入計劃免疫的疫苗之一。經廣泛應用後發病率明顯下降，免疫後的血清抗體凝集效價在1：320(保護水平)以上者可達80%-90%。無細胞百日咳疫苗可達到90%以上。
嬰兒出生後滿3個月開始接種第一針。第一針是要完成該疫苗的基礎免疫的，還需在出生後滿4個月和滿5個月時再各接種一次，也就是加強在嬰兒體內產生了抗百日咳、白喉和破傷風三種傳染病的抗體。
需要加強免疫的，還需要在1歲半至2週歲時再用百白破疫苗加強免疫1針，7週歲時用精製白喉疫苗或精製白破二聯疫苗加強免疫1針。
