在2歲以內的HIV感染患兒需及時應用抗逆轉錄藥物治療，但是目前存在的一線抗逆轉錄病毒藥物中，嬰幼兒用藥的合適劑量和安全性尚未確定，尤其是針對嬰幼兒的處方設計尚未出現。以前在欠發達地區，嬰幼兒HIV感染者最常使用司他夫定、拉米夫定和奈韋拉平三者固定劑量的聯合，目前研究發現司他夫定的毒性作用強，已不再推薦使用，而奈韋拉平由於耐藥性的出現導致其使用受限。
最新研究表明，蛋白酶抑制劑——齊多夫定、拉米夫定、洛匹那韋聯合力託那韋可以廣泛用於嬰幼兒HIV感染。但是這樣聯合三種液體劑型的藥物在實際應用中又出現了困難：一方面由於藥物口感差，導致嬰幼兒患者依存性不好，另一方面需要冰箱保存，影響了在一些欠發達地區的推廣。
靜脈注射人血丙種球蛋白(IVIG)可減少AIDS患兒合併細菌感染的發生率和縮短住院時間。靜脈注射人血丙種球蛋白(IVIG)對預防弓形體感染無效，也不能延長患兒的生命。每月定期使用靜脈注射人血丙種球蛋白(IVIG)的指徵爲低丙種球蛋白血癥，抗體反應低下和適當的抗微生物不能控制的反覆感染。
AIDS患兒由於免疫功能低下，極易病原微生物感染及機會感染。應根據臨牀病原的種類，積極進行抗感染治療及必要的預防治療。
對AIDS的治療，目前主張聯合用藥。包括抗病毒治療+免疫學治療聯合用藥以及不同類型抗病毒藥物間聯合用藥。如齊多夫定(AZT)+奈韋拉平(NVP)+阿地白介素(IL-2)聯合用藥治療。
存在以下至少2條主要症狀及2條次要症狀及體徵，並排除免疫缺陷所引起的其他原因：
1、主要症狀體徵：
○體重減輕或生長異常緩慢;
○慢性腹瀉持續1個月以上;
○長期發熱1個月以上。
2、次要症狀和體徵：
○全身淋巴結腫大;
○口、咽部念珠菌感染;
○反覆發作的常見耳部、咽部感染;
○持續性咳嗽;
○全身性皮炎;
○證實母親有HIV感染。
1、體重不增，近3-6個月內體重減輕在10%以上，營養不良，發育異常、畸形;
2、3/4的患兒有全身淋巴結腫大，明顯的黴菌或其他條件致病菌感染，機會性感染，反覆細菌感染，如敗血症、中耳炎等，肝、脾腫大、系統性淋巴瘤，腮腺腫大等;
3、肺部炎症，最常見的是卡氏肺囊蟲肺炎，此外還有淋巴間質性肺炎和肺淋巴樣增生;
4、慢性腹瀉;
5、神經系統損害引起艾滋病腦病，小兒出現頭暈、頭痛、智障、進行性癡呆、幻覺、癲癇、肢體癱瘓、運動失調等症狀，也可有腦膜腦炎、顱神經炎等表現;
6、血小板減少;
7、粘膜皮膚感染、皮膚粘膜念珠菌感染;
8、惡性腫瘤等。
