多爲腸道外疾病引起，如上呼吸道感染，化膿性扁桃體炎，肝、膽疾病，泌尿系疾病，腸道寄生蟲病均可引起腹痛。
腸寄生蟲病在既往曾是腹痛的最常見病因，近年來由於飲食衛生的改善，腸寄生蟲病已明顯減少，尤其在城市。
如潰瘍病，闌尾炎，腸梗阻，腸穿孔、脾臟破裂、急腹症等。
反覆突然發作的陣發性腹痛，疼痛部位多在臍周，程度輕重不一，重時可影響飲食及正常學習和生活，可出現哭鬧不止、翻滾，甚至面色蒼白、手足發涼、噁心、嘔吐等症狀，但發作間歇無異常體徵。
最多見的病因是飲食不當、亂吃零食，過食冷飲，便祕，消化功能紊亂引起的腹痛(亦稱功能性消化不良)。
(1)精神性：
國外亦有報告認爲與小兒心理因素障礙有關，如緊張、壓抑等。
(2)慢性胃炎及幽門螺桿菌感染：
近年來的研究認爲再發性腹痛與慢性胃炎及幽門螺桿菌感染有關。
發病機制
消化功能紊亂引起的腸痙攣的機制爲不消化的食物在腸腔內發酵、產氣刺激腸壁，或副交感神經興奮，引起一過性腸壁肌肉痙攣，暫時阻斷腸內容物的通過，於是近端腸管發生強力的收縮及蠕動的紊亂，隨着蠕動的加強，腹痛陣發性加重。
經過一定時間的痙攣後，腸壁肌肉自然鬆弛，腹痛暫時緩解，以後又可再次發作。
腹腔器官本身痛覺並不敏感。腹痛的發生大體上可有3種形式：
1、絞痛：
多由管狀器官的肌肉痙攣或梗阻(同時伴痙攣)引起，如腸管、膽管及輸尿管痙攣或梗阻，多表現爲陣發性絞痛。
2、鈍痛 ：
由器官被膜受牽扯引起，如肝、腎、闌尾及腹膜等炎症腫脹所引起的被膜牽扯，多表現爲持續性鈍痛。疼痛部位多與器官病變所在的部位一致。
3、遷移性痛：
內臟疼痛通過內臟感覺神經傳入相應的脊髓段，使進入相同節段的體神經支配部位感覺疼痛，如肝、膽病的疼痛有時可放射到右肩。
此外，腹部以外的器官疼痛有時也可放射到腹部，如大葉肺炎，帶狀皰疹侵犯腹部脊神經時都可出現較重的腹痛。破傷風的腹肌痙攣也可致劇烈的腹痛。
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