移植不成功後胚胎會被機體吸收，或者隨着下次月經排出體外。一般不會出現明顯的不適感，部分患者因自身體質的原因，會出現少量的陰道出血及腹痛的情況，屬於正常的現象。胚胎移植失敗的原因有很多，主要是染色體異常，子宮內膜過厚或過薄，周圍環境及自身免疫因素引起。
在胚胎移植不成功後，建議進行系統的檢查，明確失敗的原因，在醫生指導下對症治療。避免過度失望、焦慮，放鬆心情。調整飲食結構，合理運動，將身體調整至最佳狀態後再進行胚胎移植。
胚胎移植成功率取決於胚胎質量和子宮內環境。一般來說，胚胎移植的成功率大概在50%左右。按胚胎的質量來分，可分爲4個等級，一級、二級胚胎外觀規整，細胞分裂數目恰當，且大小均勻，碎片少，屬於優質胚胎，移植一級、二級胚胎一般都是沒問題的。三級胚胎質量要差很多，發育潛力較弱，也可以移植，但四級胚胎質量太差，不具備發育能力，一般都要求放棄移植。建議夫妻雙方放平心態，理性看到胚胎移植成功率的問題，女性在移植前注意多休息，保證充足的睡眠時間，多吃高蛋白的食物，聽從醫生的安排即可。
如果說試管嬰兒胚胎移植了，只要成功最早大約7天就可以通過驗血hcg測出來，移植後10天左右通過尿液早孕試紙測出是否懷孕，如果移植的是第5天或第6天的囊胚，還會提早兩天。
如果沒有特殊情況，沒必要測那麼早，因爲每個人胚胎着牀時間有早有晚，有人可能胚胎着牀時間比較晚，早測不一定能測出陽性的結果，反而增加焦慮、抑鬱等不良情緒的產生，對胚胎髮育會有不利的影響。大部分試管移植後沒有明顯的臨牀症狀，有些在試管着牀後出現陰道少量出血，可能會在胚胎移植的過程中傷及子宮蛻膜小血管，往往具有自限性。試管着牀成功後可能會發生早孕反應，主要有乳脹、乾嘔、乏力、嗜睡、頭暈、腹部輕微不適等。
建議移植後兩週到醫院做血HCG、雌激素、孕激素的檢測，如果這時呈陽性，數值也比較不錯，代表胚胎已經種植成功。
