子宮腺肌症，幾乎是不能自己癒合的，幾乎不會自動變好自動痊癒。
不過這個病有35%的病人，沒有任何的臨牀表現，但是有大部分人臨牀表現很明顯、症狀比較重，月經過多、月經異常、月經中期出血、痛經進行性的加重(隨着年齡增加，痛經表現越來越重)、不孕的表現。
如何治療要根據患者的年齡和有沒有生育要求以及症狀的輕重來決定。
一是藥物治療，如果沒有生育要求，症狀比較重，年齡也偏大的話。
二是手術治療，手術方式子宮全切除術。
經宮腔操作
剖宮產、診斷性刮宮、人工流產或分娩等，經宮腔的操作或手術可能會促使子宮內膜侵入子宮肌層。
子宮內膜炎症
慢性子宮內膜炎與腺肌病發病密切相關。
其他
合併子宮肌瘤。
子宮腺肌症的治療，應該根據患者的症狀、年齡和是否有生育要求而制定。
目前沒有根治性的有效藥物，一般對於症狀較輕、有生育要求以及臨近絕經期的患者，可以用達那唑、孕三烯酮、宮內放置曼月樂或GnRH治療，這些都可以緩解症狀，但是需要注意藥物的副作用，並且停藥以後，腺肌病疾病的症狀還會再出現。
年輕或者是有希望生育的子宮腺肌瘤的患者，可以行病竈切除術，但是術後有復發的風險。對於症狀較重，而且又沒有生育要求的，或者是藥物治療無效的，應該行全子宮切除術，對於是否保留卵巢應該取決於卵巢有無病變和患者的年齡。
