如果條件允許，當然選擇四價疫苗。四價疫苗比二價疫苗能多預防兩種亞型宮頸癌。
4價疫苗：默沙東(Merck)藥廠研製的四價疫苗 Gardasil(佳達修)，可預防HPV6、11、16、18四種病毒。
2價疫苗：葛蘭素史克(GSK)的二價疫苗Cervarix，可預防HPV16和 HPV18兩種病毒。
前面已經講了，二價預防宮頸癌的效力達到了84%，如果只是預防宮頸癌，它已經能滿足基本需求。 除此之外，二價還有一個優點，就是9歲起就能接種了，在早接種早保護這點上，它是最優秀的一個。
在預防宮頸癌上，四價和二價一致，都是針對高危HPV16和18型，能預防84%的宮頸癌。而多出的兩價是低危HPV6和11型，能預防近90%的生殖疣。這兩種病毒屬於低危型HPV病毒，主要能引起生殖器疣(尖鋭濕疣)。就是説四價宮頸癌疫苗不但可減少宮頸癌的風險，還可以預防男女性常見的性病皮膚病。
如果是單考慮預防癌症，2價功效優於4價。
4價中多預防個6和11號病毒，而這兩種病毒只會引起性病，如果私生活不是很混亂的話，沒必要預防性病。
