黃疸藍光治療的副作用主要有會使新生寶寶出現發熱或者腹瀉的不適，但大多數情況下不會特別的嚴重，只是一些非常輕微的症狀。藍光還可以使寶寶體內的核黃素得到分解，從而達到減輕黃疸症狀的目的，並注意在黃間消除期間，爲寶寶補充必須的鈣質和水分。在藍光治療後還需要加強寶寶的護理工作，注意寶寶皮膚的清潔和衛生。
1、在藍光治療前最好給新生寶寶先喂一些白開水，然後再喂寶寶喝奶，可以防止寶寶在接受藍光治療後出現脫水和發熱的不適。
2、由於新生寶寶在接觸藍光治療環境時，由於對環境的陌生，會哭鬧不止，身上也會大量的出汗，所以在治療後一定要及時的給寶寶擦汗，避免寶寶感冒而受涼。只要護理得當，可以減少副作用的發生。
3、在進行藍光治療的時候，需要用專門的眼罩把新生兒的眼睛矇住，以免給眼睛造成傷害，同時生殖器部位也要用東西遮蓋住，以免造成黏膜受損，只要防護得到不會給新生兒帶來影響。
要看寶寶黃疸的程度、膽紅素濃度，以及是否有併發症等等，如果黃疸比較輕，並且有媽媽母乳，肝功能比較好，沒有併發症，藍光照射3-5天患兒全身黃疸減輕，黃疸指數下降到正常就不用照藍光。所以要根據黃疸的程度、黃疸的指標，以及寶寶的臨牀症狀進行判斷。若黃疸持續時間較長，考慮爲母乳性黃疸，可在藍光治療過程中，停止母乳餵養3天，觀察黃疸消退情況。一般藍光照射在醫院住院治療，可以和醫生多溝通，配合治療，使寶寶能早日康復。
