卵泡萎縮的出現和發生對女性基礎體溫沒影響，並不會發生體溫波動現象，這時候的基礎體溫應該還是處於低溫狀態。
一般只有排卵纔會導致基礎體溫波動。在排卵日前，基礎體溫是平穩的，會持續低溫，大概在36.6℃以下，等到哪天測出基礎體溫升高了0.3℃到0.5℃，說明女性排卵了，且這之後超過12天都將保持在這樣的高溫狀態下。如果高溫持續時間低於12天，說明黃體功能不足，容易發生先兆流產。
卵泡萎縮沒有明顯的外在表現，一般是看不出來的，大多數都是因爲長時間不孕做超聲檢查，檢測卵泡發育時纔會發現。
停止發育萎縮的卵泡在超聲檢查下會看到其以每天0.2-04cm速度變小，這種情況建議結合內分泌激素水平檢查，確定病因後對症治療。
判斷卵泡萎縮的最準確方法就是通過超聲做卵泡監測檢查，當超聲結果發現，卵泡體積比之前縮小了，並以每天0.2-04cm速度變小，可懷疑是卵泡萎縮，一般一次超聲檢查結果不能確診，需要多次結果對比才行。
